1、来源不同：木薯粉是木薯与橡胶同属的槭科植物的块茎经过加工而成的，而红薯粉来源于常见的地瓜。2、食用方法不同：木薯粉中含有氰化氢，须经水浸泡后煮熟放能食用，而红薯粉中不含有氰化氢，可以直接食用。3、口感不同：木薯粉加水遇热煮熟后会呈透明状，口感带有弹性；红薯粉加工成灰色细长条状，口感与粉丝相似。
木薯粉是一种从热带植物的块根中提取的淀粉，这种植物属大槭科，与蓖麻，橡胶，小桐子同科。木薯粉是用树薯粉做成的，而树薯粉则是从树薯或木薯植物的根部精炼所得的淀粉。它是婴儿食品牛奶布丁的主要成分，也用来使汤汁及炖菜变稠。
木薯是世界三大薯类之一，广泛栽培于热带和亚热带地区。在我国南亚热带地区，木薯是仅次于水稻、甘薯、甘蔗和玉米的第五大作物。它在作物布局，饲料生产，工业应用等方面具有重要作用，已成为广泛种植的主要的加工淀粉和饲料作物。
红薯一般指番薯、地瓜等，红薯是一种高产而适应性强的粮食作物，与工农业生产和人民生活关系密切。块根除作主粮外，也是食品加工、淀粉和酒精制造工业的重要原料，根、茎、叶又是优良的饲料。