《大陆居民往来台湾通行证》有效期分为10年和5年两种：有效期为10年的往来台湾通行证签发给已满16周岁的大陆居民。有效期为5年的往来台湾通行证签发给未满16周岁的大陆居民。
如果是证件即将到期，需本人持大陆证、户口簿、身份证、入台许可到户口所在地县级以上公安出入境管理部门申请换发；如果是签注过期，可以本人或委托他人持大陆证、身份证、入台许可到户口所在县级以上公安出入境管理部门申请签注。
重庆往来台湾地区签注有效期：
L签注：团队旅游，3个月一次有效、一年多次有效。
G签注：个人旅游，6个月一次有效。
T签注：探亲、团聚、探病，6个月一次有效。
J签注：居留、依亲、返乡，3年多次有效。
X签注：赴台学习，有效期与学制相应的多次有效签注。
D签注：定居、返台，6个月一次有效。
Q签注：其他（访友、接受和处理财产、处理婚丧事宜、诉讼等私人事务，赴台就医或陪护，对台近海渔工派遣劳务），6个月一次有效。
C签注：乘务（执行两岸直航航运任务的乘务人员），1年多次有效。
Y签注：持国务院台办“赴台批件”赴台进行经济、文化、科技、体育、学术等交流活动，或者参加会议、进行两岸事务性商谈、采访，6个月一次有效、1年、2年、3年多次有效。
F签注：持国务院台办“应邀赴台立项批复”赴台进行经贸、交流活动，6个月一次有效、1年、2年、3年多次有效。